微生物学
第一节 微生物基本概念
1、微生物定义：形态微小、数量众多、结构简单。
2、三大类微生物：
（1）非细胞型微生物：包括病毒、朊粒；形体最小，纳米为单位，无细胞器，无细胞核，只有一种核酸(仅为传染性蛋白粒子)。
（2）原核细胞型微生物：荔(立克次体)枝(支原体)一(衣原体)裸(螺旋体)放(放线菌)就长细菌(细菌)、破伤风梭菌；只有核糖体，无核膜核仁，微米为单位，DNA和RNA可共存。支原体缺乏细胞壁。细胞壁：肽聚糖；细胞膜：中介体、无胆固醇。
（3）真核细胞型微生物：包括真菌(念珠菌、隐球菌、酵母菌)、小孢子菌。有各种细胞器，胞核高度分化，有细胞核，DNA和RNA可共存。
第二节 细菌的形态与结构
1、细菌的基本结构：
（1）细胞壁：主要成分是肽聚糖或称粘肽，肽聚糖---细胞壁特有，肽聚糖β-1,4糖苷键为抗生素作用部位。保持细胞固有形态，维持渗透压。
（2）细胞膜：形成中介体(参与细菌分裂繁殖)，物质转运，呼吸和分泌，生物合成。不含胆固醇。
（3）细胞质：质粒为染色体外的遗传物质。核糖体为蛋白质合成场所，胞质颗粒多为贮藏的营养物质。
（4）核质：也称细菌的染色体。无核膜、核仁和有丝分裂器。
2、细菌细胞壁结构差异在医学意义：
PG和头孢----抑制G+菌肽聚糖的五肽交联桥；
溶菌酶----可水解聚糖骨架的β-1,4糖苷键，发挥抗菌作用；
多肽类抗生素万古霉素和杆菌肽----抑制四肽侧链的连结；
磷霉素----抑制聚糖骨架的合成。
| 细胞壁结构 | 革兰氏阳性菌 | 革兰氏阴性菌 |
|---|---|---|
| 磷壁酸 | 有 | 无 |
| 外膜 | 无 | 有 |
| 脂多糖 | 无 | 有 |
| 外膜蛋白(OMP) | 无 | 有 |
3、质粒：是核质以外的遗传物质，主要有耐药性R质粒、编码性菌毛F质粒，赋予细菌致病性和耐药性。
胞质颗粒：又称内含物，用于细菌鉴别诊断。
异染颗粒：常见于白喉棒状杆菌，鉴别白喉、鼠疫、结核。
4、细菌的特殊结构：荚膜、鞭毛、菌毛、芽胞。
（1）荚膜：抗吞噬作用(增强细菌侵袭力)，黏附作用，鉴别细菌。
（2）鞭毛：运动器官，具有抗原性并与致病性有关。
（3）菌毛：普通菌毛可促使细菌粘附于宿主细胞表面而致病；细菌毒力、耐药性等可通过性菌毛接合作用传递；性菌毛---噬菌体吸附于F+菌，并使后者获取致病物质。
（4）芽胞：是细菌的休眠形式，不是细菌的繁殖方式，都是G+菌产生，抵抗力强，耐高温。内含生命物质，可以再生。通常以杀死芽胞作为灭菌指标。1.05kpa，121.3℃，15-20分钟灭除。
炭疽芽孢杆菌芽孢---卵圆形，比菌体小，位于菌体中央
破伤风梭菌芽孢-----正圆形，比菌体大，位于顶端
肉毒梭菌芽孢-------比菌体大，位于次极端
5、细菌玻片涂片经结晶紫初染→碘液媒染→95%乙醇脱色→复红复染。未被脱色而呈紫色者为G+菌；经乙醇脱色，被复红染成红色的为G-菌。
第三节 细菌的生理
1、细菌繁殖方式：二分裂方式进行无性繁殖，并向不同平面分裂而形成细菌排列方式的不同。细菌的分裂周期所需时间，称为代时。分为迟缓期；对数期：生长迅速，典型；稳定期：细菌形态和生物学性状有所改变，如产生代谢产物；衰亡期。
2、热源质：也称致热源，为细胞壁的脂多糖。大多是G-菌合成的。
3、细菌素：细菌产生的一类具有抗菌作用的蛋白质。只对近缘关系的细菌有杀伤。用于细菌的分型和流行病学追踪调查。
4、内毒素由G-菌产生；铜绿假单胞菌可产生绿色色素；大肠埃希菌能合成B族维生素和维生素K。
第四节 消毒与灭菌
1、消毒：杀灭物体上或环境中的病原微生物，不一定能杀灭芽胞或非病原微生物。
2、灭菌：指杀灭所有微生物。
3、湿热灭菌法：巴氏消毒法、煮沸法、高压蒸汽灭菌法等
（1）巴氏消毒法：不使蛋白质变性。加热62℃--30分钟、71.7℃--15-30秒。
（1）高压蒸汽灭菌法：1.05kpa/cm2、121.3℃、15-20min。不能杀灭朊粒。
4、紫外线消毒：以波长265-266nm杀菌作用最强，仅适用于直射物品表面消毒及对空气的消毒，不能用于微生物的灭活处理。
5、噬菌体：病毒，只能在活的微生物内复制繁殖，专性胞内寄生，由核酸和蛋白质组成。
温和噬菌体：也称溶原性噬菌体，本身不增殖，不产生子代，不引起细菌裂解，随细菌复制而复制分配至子代细菌基因中；这种整合在细菌染色体上的噬菌体基因称为前噬菌体。某些前噬菌体可导致细菌基因型和性状的改变，称为溶原性转换。
6、细菌的遗传与变异： R质粒--耐药质粒，R--耐药，F质粒--致育性质粒，Vi质粒--毒力质粒。质粒在细菌间的主要转移方式：接合。
第七节 细菌的感染与免疫
双歧杆菌----对人体有益，其余均无益。
1、菌群失调症：由于菌群失调引起的疾病。主要诱因----抗生素滥用，主要原因：正常菌群的组成和数量明显改变。
2、细菌的致病性取决于三点：细菌的毒力、侵入数量、侵入部位。
细菌毒力：包括侵袭力和毒素，一般采用半数致死量(LD50)或半数感染量(ID50)作为指标。
侵袭力包括黏附素、荚膜、侵袭素、侵袭性酶类、细菌生物被膜等。
外毒素，芽孢----无侵袭力。
有侵袭力的5种成分：外膜、脂多糖、荚膜、鞭毛、菌毛。
3、●外毒素、内毒素区别
（1）来源：外阳内阴：外毒素主要为G+，内毒素主要为G-。
（2）释放方式：外活内死：外毒素生活状态下释放，内毒素死亡裂解释放。
（3）化学成分：外蛋内糖：外毒素为蛋白质，不稳定；内毒素为脂多糖，耐热。
（4）抗原性：外毒素可经甲醛处理脱毒成类毒素，内毒素不能。毒性，抗原性---外强内弱。
4、几个概念：
（1）菌血症：病原菌入血，未大量繁殖和引起严重临表。
（2）毒血症：病原菌不入血，外毒素入血，使机体致病。
（3）败血症：病原菌入血大量繁殖并产生毒素，引起全身中毒症状。
（4）脓毒血症：化脓性细菌入血并大量繁殖，引起严重的中毒症状，并通过血流扩散产生新的化脓病灶。
胞外菌感染常导致急性感染，以体液免疫为主；大多数致病菌。
胞内菌感染常导致慢性感染，以细胞免疫为主；兼性胞内菌有结核、麻风分枝杆菌，伤寒沙门菌，布鲁菌和嗜肺军团菌；专性胞内菌有立克次体、衣原体。
外毒素致病的免疫特点：霍乱弧菌、白喉棒状杆菌和破伤风梭菌等仅在黏膜或局部寄生，毒素入血而致病，不产生菌血症；鼠疫耶尔森菌可引起菌血症、脓毒血症。毒血症主要依靠抗毒素治疗。
5、病原学检测-----细菌学诊断的金标准。
血清学诊断：取双份血清，恢复期或1周后血清抗体效价比早期升高4倍(含4倍)时，可确认为现症感染。
血清学诊断方法：
①直接凝集试验：伤寒副伤寒--肥达反应；立克次体--外斐试验；钩体--显微凝集试验。
②补体结合试验：诊断Q热柯克斯体等。
③中和试验：诊断链球菌风湿病的抗O试验等。
④乳胶凝集试验：诊断流感嗜血杆菌、脑膜炎奈瑟菌等。
⑤ELISA：广泛应用与细菌、病毒等。
6、人工主动免疫：指给机体注入抗原物质，使之产生体液和细胞免疫的过程。
常用制剂：卡介苗、鼠疫减毒活疫苗、百日咳灭活菌苗、伤寒灭活菌苗、白喉类毒素、破伤风类毒素、乙肝重组疫苗。
7、人工被动免疫：指将含有特异性抗体的免疫血清或免疫细胞因子等直接注入机体，使之立刻获得免疫力。
常用制剂：抗毒素、丙种球蛋白、细胞免疫制剂。
第九节 病原性球菌
1、葡萄球菌属：无芽孢、无鞭毛、无荚膜。可产生凝固酶、杀白细胞素、溶素等。
肠毒素作用机制：毒素与肠道神经细胞受体作用，直接或间接刺激呕吐中枢，引起以呕吐症状为主的食物中毒---剩饭、乳制品。
血浆凝固酶---鉴定致病性葡萄球菌的重要指标。
基础部分：脓---球；G+。
2、链球菌：无鞭毛、无芽孢、幼龄菌可有透明质酸形成的荚膜。猩红热、风湿热和急性肾炎。G+。
甲型溶血性链球菌(草绿色链球菌)可引起龋齿、亚急性感染性心内膜炎。
肺炎链球菌主要致病因素有荚膜、溶血素、脂磷壁酸、神经氨酸酶和紫癜形成因子。
3、淋病奈瑟菌的致病物质：菌毛、脂寡糖、IgA1蛋白酶、外膜蛋白。其中IgA1蛋白酶破坏黏膜细胞表面的特异性SIgA1，人类是淋病奈瑟菌的惟一宿主。需巧克力培养基。G-。脑膜炎奈瑟菌含有自溶酶，离体或低温下很容易死亡。
第十节 肠道杆菌
1、乳糖发酵试验：致病菌---不分解乳糖，非致病菌---分解乳糖。
2、肠出血型大肠埃希菌(EHEC)：病原体为EHEC O157:H7血清型引起的反复出血性腹泻和严重腹痛为特征的急性出血性结肠炎，大量血样便。
3、大肠菌群数：每升水≤3个，每100ml瓶装汽水或果汁≤5个。
1985年旧标准(GB5749-85)：每毫升饮用水、饮料中细菌总数不超过100个。
4、志贺菌属也称痢疾杆菌，粘液脓血便，使用抗生素之前采样。
5、沙门菌属：无症状带菌者的细菌潴留在胆囊中。
肥达试验：菌体抗原即O抗原，稳定，抗体属于IgM，出现较早，持续约半年，消退后不易出现；鞭毛抗原即H抗原，抗体属于IgG，出现较晚，持续数年，消退后易出现。
O、H凝集效价：均高提示肠热症可能性大；O高H不高提示感染早期；O不高H高提示预防接种或非特异性回忆反应。
第十一节 弧菌属
1、霍乱弧菌：无芽孢、无荚膜，其他全有。可在无盐环境中生长，其他弧菌则不能。G-。兼性厌氧，营养要求不高，需碱性蛋白胨培养基。取病人米泔水样便做悬滴观察见细菌呈穿梭样或流星状运动。直接涂片见鱼群状排列。
2、副溶血性弧菌：主要存在于海水、海底沉积物和海产品中。在含有35g/L NaCl培养基上最易生长，无盐则不能生长，故称耐盐细菌。
重点总结
1、微生物的分类：（三型八大类)**全部是重点**
| 三型 | 八大类 | 特点 |
|---|---|---|
| 非细胞型微生物 | 病毒、亚病毒和朊粒 | 无细胞结构，结构最简单，体积最微小，能通过滤菌器； 单一核酸； 自我复制方式进行增殖 |
| 原核细胞型微生物 | 细菌、放线菌、螺旋体、支原体、衣原体、立克次体 | 仅有原始核； 缺乏完整细胞器。 |
| 真核细胞型微生物 | 真菌、原虫 | 细胞核分化程度较高； 有丝分裂进行繁殖； 有多种完整细胞器。 |
2、（正常菌群）条件致病性微生物——临床上多引起内源性感染。
3、G+菌特有成分：磷壁酸（重要表面抗原，可用于细菌血清学分型）（外毒素） 4、G-菌特有成分：外膜层（由脂多糖（内毒素）、脂质双层（磷脂）、脂蛋白）
5、G+菌和G-菌细胞壁的共同成分是肽聚糖。结构由聚糖骨架、四肽侧链和五肽交联桥（G-菌无。是溶菌酶、青霉素作用部位）
6、细菌的主要遗传物质：核质（染色体）、质粒（存在于胞质，双链闭合环状DNA分子）、转位因子
7、细菌特殊结构：荚膜（保护，致病，抗原性，鉴别）、芽胞、鞭毛（运动器官）、菌毛（普通菌毛—粘附，致病性；性菌毛—接合方式转移遗传物质）
*将芽胞是否被杀死而作为判断灭菌效果的指标
8、L型（细胞壁缺陷）菌落：①“油煎蛋”（荷包蛋）样菌落（典型L型细菌）。②颗粒型菌落（简称G型菌落）③丝状菌落（简称F型菌落）。高渗环境生长。（环丙沙星）
9、自营菌：以无机物为原料；异营菌(腐生菌：以无生命的有机物质为营养物质；寄生菌：以宿主体内有机物为原料),所有致病菌都是异营菌。
10、细菌营养物质：水、碳源、氮源、无机盐类和生长因子。
11、细菌个体的生长繁殖方式：无性二分裂，在对数期以几何级数增长
12、细菌分类（伯杰）等级依次为界、门、纲、目、科、属、种（最小分类单位）。
13、常用的细菌培养方法是：需氧培养法、二氧化碳培养法和厌氧培养法；
14、通常由正常无菌部位采取的标本接种血平板，置于空气或含5%～10%CO2的气缸中培养，大部分细菌可于24～48h生长良好。
15、血清学诊断时，一般要在病程早期和晚期分别采血清标本2～3份检查，抗体效价呈4倍或以上增长才有价值。
16、透射电子显微镜适于观察细菌内部的超微结构；扫描电子显微镜适于对细菌表面结构及附件的观察。
17、细菌染色的基本程序：涂片（干燥）→固定→初染→染色（媒染）→（脱色）→（复染，使脱色菌体着色）。
18、胃部细菌喜酸，肠道细菌喜碱
19、SS琼脂有较强的抑菌力，用于志贺菌和沙门菌的分离。因选择性过强，可影响检出率，所以，使用时最好加一种弱选择平板以配对互补。
20、碱性琼脂或TCBS琼脂用于从粪便中分离霍乱弧菌及其他弧菌。
21、痰标本：血平板、中国蓝／麦康凯、巧克力平板作分离。
22、中国蓝／麦康凯用于筛选G-杆菌；
23、含杆菌肽的巧克力平板（含有V和X因子）用于筛选嗜血杆菌
24、连续划线分离法：杂菌不多的标本。 分区划线分离法：杂菌量较多的标本。
25、斜面接种法：该法主要用于单个菌落的纯培养、保存菌种或观察细菌的某些特性
26、倾注平板法：牛乳、饮水和尿液细菌计数
27、涂布接种法：常用于纸片法药物敏感性测定，也可用于被检标本中的细菌计数。
28、半固体培养基用于观察细菌的动力（沿穿刺线生长呈模糊或根须状，并使培养基变混浊为动力阳性）
29、α溶血：菌落周围血培养基变为绿色环状；红细胞外形完整无缺。 β溶血：红细胞的溶解在菌落周围形成一个完全清晰透明的环。 γ溶血：无溶血。 双环：在菌落周围完全溶解的晕圈外有一个部分溶血的第二圆圈。
30、氧化-发酵试验（O/F试验）：有氧参加——氧化型；无氧降解——发酵型；不分解葡萄糖而分解蛋白胨——产碱型。（肠杆菌科细菌发酵型全+）
31、甲基红试验(与V-P试验相反)：阳性红色，阴性黄色。大肠埃希菌（+），产气肠杆菌(-)
32、白喉棒状杆菌：G+，异染颗粒、毒力试验，Elek平板，亚碲酸钾血琼脂。外毒素（毒血症）只有携带β-棒状噬菌体的溶原性白喉杆菌才能产生外毒素。
33、内毒素测定主要用于确诊患者是否发生G-细菌感染。常采用鲎试验。本方法灵敏度高，可检查出0.0005～0.005μg/ml内毒素。
外毒素主要用于确诊患者是否感染革兰阳性菌及部分阴性菌。常用体内及体外毒力试验检测，也可通过ELISA法测定。
**34、葡萄球菌属：**G+，耐热、耐干燥、耐高盐，是抵抗力最强的无芽胞细菌。
凝固酶阳性葡萄球菌：金黄色葡萄球菌、中间型葡萄球菌和家畜葡萄球菌
凝固酶阴性葡萄球菌（CNS）：表皮葡萄球菌（新生霉素敏感，医院感染，血培养污染）、腐生葡萄球菌（新生霉素耐药，凝固酶阴性。尿路感染）
蛋白抗原：葡萄球菌A蛋白（SPA）：完全抗原，有种属特异性，无型特异性。抗吞噬作用。多糖抗原：半抗原，型特异性。
**35、金黄色葡萄球菌：**触酶试验、凝固酶试验（最简单）、耐热DNA酶试验、甘露醇发酵试验均阳性。对新生霉素敏感。透明溶血环。
致病性：感染（化脓性感染，食物中毒，表现为急性胃肠炎），医院内感染，毒素性疾病。主要致病物质有血浆凝固酶、葡萄球菌溶血素、杀白细胞素、肠毒素、表皮溶解毒素和毒性休克综合征毒素等。
耐药性检测：检耐甲氧西林金葡菌（MRSA），耐甲氧西林的凝固酶阴性葡萄球菌（MRSE），耐万古霉素金葡菌（VRSA），耐万古霉素表皮葡萄球菌（VRSE）。NCCLS/CLSI推荐用头孢西丁纸片法检测mecA基因介导对苯唑西林耐药的葡萄球菌。
**36、链球菌属：**G+球菌，触酶阴性。在液体培养基中生长时易形成长链而表现为沉淀生长。5%CO2环境。抵抗力不强，对各种常用消毒剂敏感，60℃加热30分钟即可杀灭。
A群链球菌（猩红热）——杆菌肽敏感；B群链球菌（败血症、肺炎、脑膜炎、咽喉炎）——CAMP试验阳性（与金葡菌，箭头状溶血），水解马尿酸；D群链球菌——七叶苷试验阳性（40%胆汁培养基，变黑）；
甲型（α）溶血性链球菌：菌落呈灰色针尖状，菌落周围有1～2mm宽的草绿色溶血环，故又称草绿色链球菌。本菌为条件致病菌。
乙型（β）溶血性链球菌：通称溶血性链球菌，菌落较小，灰白色，菌落周围有2～4mm宽的透明溶血环。该型细菌致病性最强，常引起人和动物多种疾病。
丙型（γ）链球菌：呈灰白色细小菌落，在菌落周围无溶血环。一般无致病性。
致病物质：链球菌溶血素、致热外毒素、透明质酸酶、链激酶、链道酶及M蛋白等。人类链球菌感染中85%以上由A群链球菌引起，对青霉素G高度敏感
化脓型链球菌：杆菌肽敏感试验阳性。
**肺炎链球菌：**混浊生长，有荚膜（荚膜肿胀试验：阳性），大叶性肺炎。
分解菊糖、胆汁溶解试验阳性、Optochin敏感试验阳性——与草绿色链球菌鉴别。
37、肠球菌属：G+，触酶试验阴性，与同科链球菌的显著区别在于肠球菌能在高盐（6.5%NaCl）、高碱（pH9.6）、40%胆汁培养基上和10～45℃环境下生长，并对许多抗菌药物表现为固有耐药。重要医院感染病原菌，常引起尿路感染，其中大部分为医院感染，
38、奈瑟菌属：G-双球菌，无鞭毛，无芽胞，有菌毛。专性需氧，氧化酶阳性。
脑膜炎奈瑟菌：流行性脑脊髓膜炎（简称流脑），空气传播，对人致病的主要是A群。氧化酶、触酶试验阳性；分解葡萄糖、麦芽糖产酸不产气。
39、淋病奈瑟菌：不酵解麦芽糖与蔗糖、30%H202试验阳性（与脑膜炎奈瑟菌鉴别）、
40、卡他莫拉菌：社区呼吸道感染的主要病原体之一
**41、肠杆菌科：**均为G-杆菌。均不形成芽胞。多数有周鞭毛（运动），少数菌属细菌可形成荚膜。发酵葡萄糖产酸、产气，触酶阳性。(鉴别肠道致病菌和非致病菌常选用葡萄糖发酵试验)
*菌体（O）抗原，鞭毛（H）抗原和表面抗原（如Vi抗原、K抗原）少数菌属如志贺菌属和克雷伯菌属无鞭毛，无运动能力。
42、大肠埃希菌：俗称大肠杆菌，肠道正常菌群。泌尿系统感染。超广谱β-内酰胺酶（ESBLs）的主要产酶株。
尿素酶试验阴性，吲哚、甲基红、V-P、枸橼酸盐试验（IMViC）＋＋－－，
克氏双糖铁琼脂（KIA）上斜面和底层均产酸产气，H2S阴性，动力、吲哚、尿素（MIU）＋＋－。硝酸盐还原、动力多数阳性。
**引起肠道感染的大肠埃希菌有下列五个病原群。 （1）肠产毒性大肠埃希菌（ETEC）：引起霍乱样肠毒素腹泻（水泻）。 （2）肠致病性大肠埃希菌（EPEC）：主要引起婴儿腹泻。 （3）肠侵袭性大肠埃希菌（EIEC）：可侵入结肠黏膜上皮，引起痢疾样腹泻（黏液脓血便）。 （4）肠出血性大肠埃希菌（EHEC）：又称产志贺样毒素（VT）大肠埃希氏菌（SLTEC或UTEC），其中O157:H7（常规检测项目）可引起出血性大肠炎和溶血性尿毒综合征（HUS）。临床特征为严重的腹痛、痉挛，反复出血性腹泻，伴发热、呕吐等。严重者可发展为急性肾衰竭。
（5）肠黏附性大肠埃希菌（EAggEC）：腹泻
*与志贺菌相鉴别：醋酸钠和葡萄糖铵利用试验及粘质酸盐产酸三种试验。大肠埃希菌均为阳性，而志贺菌均为阴性。
43、志贺菌属：痢疾杆菌（细菌性痢疾）。我国以福氏和宋内志贺菌引起的菌痢最常见。强选择鉴别培养基——沙门、志贺菌选择培养基（SS）；弱选择培养基——麦康凯或中国蓝培养基。
分解葡萄糖产酸不产气，不分解乳糖（宋内志贺菌可迟缓分解乳糖），MR试验阳性，只有O抗原而无鞭毛抗原，
伤寒沙门菌硫化氢和动力阳性
致病因素为侵袭力、内毒素及外毒素
44、沙门菌属：无芽胞，无荚膜的革兰阴性直杆菌。有周身鞭毛（除鸡沙门菌外），能运动，多数有菌毛。
***伤寒沙门菌：产酸不产气。动力＋、脲酶＋，氧化酶一，触酶＋，硝酸盐还原＋。肥达试验。S～R变异（光滑变粗糙，生理盐水中自凝）；H～O变异（失去鞭毛）；相位变异（双相变单相）；V～W变异（失去Vi抗原）。
肠热症（伤寒与副伤寒病，慢性发热症状）。第1、2周采血液，第2、3周采粪便与尿液。整个病程中骨髓分离细菌阳性率较高。）
45、变形杆菌属：迁徙生长。具有尿素酶，可以水解尿素，产生氨
普通变形杆菌：靛基质和麦芽糖均阳性，鸟氨酸脱羧酶阴性；奇异变形杆菌相反。
外-斐反应：普通变形杆菌OX19、OX2、0Xk的菌体抗原与某些立克次体有共同抗原，是用以诊断某些立克次体病的依据。
46、鼠疫耶尔森菌：鼠疫。两极浓染。“钟乳石”状。28～30℃。KIA结果利用葡萄糖，不利用乳糖，不产H2S，MIU均为阴性反应，丙氨酸脱氨酶试验呈阴性反应即可初步鉴定。
47、小肠结肠炎耶尔森菌：翻滚旋转状运动。VP试验25℃阳性，37℃阴性，鸟氨酸脱羧酶阳性。脲酶阳性
48、假结核耶尔森菌：两端浓染。25℃培养有周鞭毛，有动力，37℃培养无动力。
49、肺炎克雷伯菌：医院感染，有荚膜，G-杆菌。灰白色大而黏的菌落，长丝状。触酶阳性、脲酶阳性。动力和鸟氨酸脱羧酶阴性是本菌的最大特点。易产超广谱β-内酰胺酶。对氨苄西林天然耐药。
50、肠杆菌属（阴沟肠杆菌、产气肠杆菌）有周鞭毛，能运动。IMVC：肠杆菌属多为－－＋＋；而大肠埃希菌是＋＋－－。
51、黏质沙雷菌：革兰阴性细小杆菌。沙雷菌具DNA酶和葡萄糖酸盐阳性（与其他菌属细菌的根本区别）
**52、弧菌科:G-**杆菌。共同特点是一群氧化酶阳性、具有极端鞭毛、动力阳性、发酵葡萄糖。
弧菌属极端鞭毛、甘露醇、脂酶、生长需要NaCl、对O129敏感五项为＋＋＋＋＋
*霍乱弧菌（耐碱不耐酸，pH8.4～9.2时生长最好）——霍乱（米泔水样粪便）；副溶血性弧菌（无盐不生长，绿色菌落）——食物中毒（海产品）。
*不染色标本穿梭流星状运动（鱼群状）；O1群霍乱弧菌诊断血清，如果原运动活泼的现象停止（为制动试验阳性）
在碱性琼脂平板上——水滴状菌落。在TCBS（强选择）上——黄色菌落。在含亚碲酸钾（或庆大霉素）琼脂平板上——菌落中心呈灰褐色
氧化酶、明胶酶试验和ONPG试验均阳性。能产生靛基质，霍乱红反应（即亚硝基靛基质试验）阳性（非特异性）。
53、气单胞菌属：在65g/L NaCl中不生长。氧化酶试验阳性可与肠杆菌科细菌鉴别，发酵葡萄糖可与非发酵菌鉴别；
54、弯曲菌属细菌：革兰阴性菌。空肠弯曲菌、大肠弯曲菌在43℃生长，25℃不生长；胎儿弯曲菌在25℃生长，而43℃不生长；简明弯曲菌在25℃和43℃均不生长。空肠弯曲菌马尿酸水解试验阳性，是引起散发性细菌性肠炎最常见的菌种之一
55、幽门螺杆菌：G-菌，氧化酶、触酶试验、DNA酶均阳性，快速脲酶试验强阳性。在37℃能够生长，在25℃和42℃均不能生长，有动力。
**56、厌氧菌：**一类是革兰染色阳性有芽胞的厌氧芽胞梭菌（外毒素），另一类是无芽胞的革兰阳性及革兰阴性球菌与杆菌（正常菌群，条件致病性的内源性感染）。气-液相色谱分析
**有芽胞的厌氧菌只有梭菌属
*放线菌感染——硫黄样颗粒
常规血培养阴性的细菌心内膜炎、并发脓毒症血栓性静脉炎、伴有黄疸的菌血症等，应考虑可能有厌氧菌感染。
| 双歧杆菌 | G＋b | 多形性，有分支呈Y、V形成棒状，标本有醋酸气味 |
|---|---|---|
| 破伤风梭菌 | G＋b | 细长、梭形或鼓槌状，有芽孢（芽胞形成后，易转变为革兰阴性），有周鞭毛（鞭毛抗原有型特异性） |
| 产气荚膜梭菌 | G＋b | 粗大杆菌，呈单或双排列，有芽孢，有荚膜。“汹涌发酵”，α毒素（毒血症）；感染——产生大量气体，捻发感。选择培养基——卵黄（EYA）及兔血平板（RBA） |
| 肉毒梭菌 | G＋b | 汤匙状或网球拍状，对酸的抵抗力比较强，可被胃吸收。单纯毒性中毒，肌肉麻痹 |
七叶苷胆汁平板（BBE，用于脆弱类杆菌），FS培养基（梭杆菌选择培养基）
57、艰难梭菌——CCFA培养基，菌落黄色。紫外线照射下呈黄绿色荧光。本菌感染与大量使用抗生素有关。假膜性肠炎，使用有关抗生素一周后突然出现。
58、脆弱类杆菌引起败血症
59、炭疽芽胞杆菌：人畜共患病，是致病菌中最大的革兰阳性杆菌，竹节状。倒松树状。（皮毛—皮革厂）。串珠试验。
60、蜡样芽胞杆菌：表面粗糙似毛玻璃状或融蜡状。干热120℃经60分钟才能杀死。
61、产单核李斯特菌：20℃有动力，37℃动力缓慢，冷增菌（4℃）。伞状生长。通过胎盘或产道感染新生儿。本菌常伴随EB病毒引起传染性单核细胞增多症。
62、结核分枝杆菌：pH 6.5～6.8。无内外毒素和侵袭性酶。人型结核分枝杆菌烟酸试验、硝酸盐还原和烟酰胺酶试验均为阳性，借此可与牛型结核分枝杆菌鉴别。Koch现象。Ⅳ型变态反应。罗氏培养基。
*在体内外经青霉素、环丝氨酸或溶菌酶诱导可影响细胞壁中肽聚糖的合成，异烟肼影响分枝菌酸的合成，巨噬细胞吞噬结核分枝杆菌后溶菌酶的作用可破坏肽聚糖，均可导致其变为L型，呈颗粒状或丝状。
*卡介苗：毒力变异（减弱）保留抗原性。被动人工免疫。
63、麻风分枝杆菌：泡沫状，麻风细胞。
**64、不发酵菌：**不发酵或不分解糖类的G-无芽胞需氧杆菌。
***铜绿假单胞菌：绿脓杆菌。是医院感染的主要病原体之一。灰绿色或蓝绿色菌落，菌落周围有透明溶血环。对亚胺培南耐药主要原因之一是产生金属酶。
**不动杆菌属：生物学特征为“三阴”，即氧化酶、硝酸盐还原试验、动力阴性。鲍曼不动杆菌。
*产碱杆菌属：在含有蛋白胨的肉汤中产氨，可使pH上升至8.6。
*军团菌属：人工管道的水源中常存在此菌，如医院空调冷却水中常有此菌，对常用化学消毒剂敏感。活性炭-酵母浸出液琼脂。肺部感染。
65、流感嗜血杆菌：G-短小杆菌。加热血平板。（与金葡菌）卫星现象。脑膜炎。荚膜上的多糖抗原被称为M抗原。需要X因子、Ⅴ因子。
副流感嗜血杆菌：不需要Ⅹ因子。杜克嗜血杆菌本菌生长需要X因子，不需要Ⅴ因子。
66、杜克嗜血杆菌可引起软性下疳。
67、百日咳鲍特菌：鲍-金培养基
68、布鲁菌属：人畜共患病，菌血症，波浪热。首选多西环素。
**69、衣原体：**是一群体积较小，能通过细菌滤器，细胞内专性寄生，并有独特发育周期的原核细胞型微生物。鸡胚卵黄囊
原体：为成熟的衣原体。吉姆萨染色呈紫色，Macchiavello染色呈红色。在细胞外较为稳定，无繁殖能力，但有高度感染性。
始体（网状体）：吉姆萨染色和Macchiavello染色均呈蓝色。为衣原体发育周期中的繁殖型，代谢活泼，不能自胞外存活，无感染性。
*衣原体细胞壁LPS为属特异性补体结合抗原
**沙眼衣原体（2SP培养基。碘液染色阳性）：沙眼，非淋菌性泌尿生殖道感染（男性常见），性病淋巴肉芽肿。
*鹦鹉热衣原体：典型临床表现为非典型肺炎
70、克次体：是一类严格寄生在细胞内的原核细胞型微生物。菌体内同时含有DNA和RNA。
*普氏立克次体常以人的体虱为传播媒介，流行性斑疹伤寒（又称虱传斑疹伤寒）。流行性斑疹伤寒的外斐反应效价在1:160时有诊断意义。
*莫氏立克次体（斑疹伤寒立克次体，外斐反应）的贮存宿主是鼠类，主要传播媒介是鼠蚤或鼠虱，地方性斑疹伤寒（又称鼠型斑疹伤寒）。
*恙虫病立克次体：通过恙螨幼虫叮咬传给人类，引起恙虫病。贝纳柯克斯体（又称Q热立克次体）引起Q热。
**71、支原体：**是一类无细胞壁、呈高度多形态性，能通过除菌滤器，在人工培养基上能生长繁殖的最小原核型微生物。革兰染色为阴性。无细胞壁仅有细胞膜是与细菌区别的主要特点。菌落呈“荷包蛋”样。
**肺炎支原体：酒瓶状。是人类原发性非典型性肺炎的主要病原体之一。补体结合试验（≥1:64～1:128为阳性）（检测IgM抗体）
72、诺卡菌属：外源性感染。库欣综合征、糖尿病
73、螺旋体
| 疏螺旋体属 | 伯氏疏螺旋体 | 莱姆病 | 硬蜱 |
|---|---|---|---|
| （包柔螺旋体属） | 回归热螺旋体 | 流行性回归热 | 体虱 |
密螺旋体属 （苍白亚种） | 梅毒螺旋体（镀银染色） | 梅毒 | 性传播 |
*钩端螺旋体：Fontana镀银染色法染成深褐色。钩体病（人畜共患病及自然疫源性疾病）。发病1周内血液的阳性率高，1周后尿和脑脊液等的阳性率高。
**梅毒的临床病程分三期：
第一期为硬性下疳，极易传播感染，也适于涂片镜检。
第二期即梅毒疹期，全身皮肤黏膜出现皮疹，伴有淋巴结肿大，可累及骨、关节、眼及中枢神经系统。
第一、二期称早期梅毒，传染性强，破坏性较小。部分早期梅毒可进一步发展到第三期梅毒，即晚期梅毒。病损部位螺旋体少但破坏性大。严重者可出现心血管和中枢神经系统受损，可危及生命。后天性梅毒表现为反复隐伏发病和再发的特点。
74、噬菌体是病毒
75、流行性感冒病毒：正黏病毒科。血凝素（HA）、神经氨酸酶（NA），划分流感病毒亚型的依据。常用鸡胚接种培养，初次分离接种羊膜腔为最佳，传代适应后可移种尿囊腔。细胞培养一般用原代猴肾细胞（PMK）或犬肾传代细胞（MDCK）。不耐热，对干燥、日光、紫外线以及甲醛、乙醇等均敏感。
76、呼吸道合胞病毒：不能在鸡胚中增殖，引起婴幼儿下呼吸道疾病的最常见的病毒。最常见的传播途径是经飞沫传染，最易引起婴幼儿细支气管炎和细支气管肺炎
77、麻疹病毒：飞沫直接传播。麻疹疫苗，8月龄接种。
78、肠道病毒：属小RNA病毒科肠道病毒属。由粪-口途径传播。是人类最常见最重要的病毒。脊髓灰质炎病毒、柯萨奇病毒、埃可病毒
*轮状病毒：（秋季腹泻）婴幼儿急性腹泻的主要病因
79、流行性乙型脑炎病毒：可通过三带喙库蚊叮咬传播，引起流行性乙型脑炎，简称乙脑。猪为最重要的宿主和传染源。
80、登革病毒：登革热。埃及伊蚊和白纹伊蚊等传播
81、巨细胞病毒：猫头鹰眼特征
82、甲肝病毒：毛蚶
83、乙型肝炎病毒是DNA病毒，其他肝炎病毒均为RNA病毒。
84、HIV：gp120、gp41
85、狂犬病病毒：嗜酸性包涵体（内基小体）。神经兴奋性增高，恐水病。
87、HPV：只能感染人的皮肤、黏膜的上皮细胞。尖锐湿疣主要由HPV-6引起
88、朊病毒（亚病毒，还包括类病毒、卫星病毒）就是蛋白质病毒，是只有蛋白质而没有核酸的病毒。中枢神经系统退化性病变
89、酵母型细胞和菌丝、孢子被染为革兰阳性（深紫色）。
**假丝酵母菌（俗称念珠菌）：出芽繁殖（芽生孢子）。芽管形成试验，假菌丝。沙保弱培养基。玉米粉培养基形成厚膜孢子。
**新型隐球菌：有荚膜，折光性强。印度墨汁作负染色。尿素酶试验阳性
*鉴定曲霉菌常用察氏琼脂
*卡氏肺孢菌病是AIDS最常见、最严重的机会感染性疾病。
*马尔尼菲青霉可引起马尔尼菲青霉病（感染）
90、扩散法（K-B法）：选择直径6.35mm，吸水量20μl的专用药敏纸片。
质控菌株采用标准菌株是进行质控的主要措施，应从可靠的菌种保藏中心索购，金黄色葡萄球菌ATCC25923，大肠埃希菌ATCC25922，铜绿假单胞菌ATCC27853及粪肠球菌ATCC29212或ATCC33186用于对试验结果进行监测。
琼脂稀释法是细菌药敏试验的金标准。释法所测得的某抗菌药物抑制待测菌生长的最低浓度为最低（或最小）抑菌浓度（MIC），稀释法也可测定最小杀菌浓度（MBC）。
91、细菌耐药的机制 1.产β-内酰胺酶是细菌对β-内酰胺类药物耐药的主要机制。 2.产生钝化酶如氨基糖苷类钝化酶、氯霉素乙酰转移酶等。 3.青霉素结合蛋白的改变如MRSA的耐药机制。 4.药敏作用靶位的改变如核糖体位点的改变引起大环内酯类、林可霉素耐药。
5.抗菌药物渗透障碍
92、消毒是去除或杀灭大多数微生物的过程。灭菌是去除或杀灭所有微生物的过程。
碳水化合物的代谢试验
1.糖（醇、苷）类发酵试验：肠杆菌科细菌。 2.氧化-发酵试验（O/F试验）：肠杆菌科细菌（发酵型）与非发酵菌（氧化型或产碱型）的鉴别。
3.β-半乳糖苷酶试验（ONPG试验）：迟缓发酵乳糖菌株的快速鉴定。分解乳糖的细菌ONPG试验为阳性，而不发酵乳糖的细菌为阴性。 4.七叶苷水解试验：D群链球菌阳性，其他链球菌阴性。 5.甲基红试验：大肠埃希菌阳性；产气肠杆菌阴性。 6.V-P试验：与甲基红试验结果相反。
蛋白质和氧基酸的代谢试验
1.明胶液化试验：肠杆菌科细菌的鉴别，如沙雷菌、普通变形杆菌、奇异变形杆菌、阴沟杆菌等可液化明胶，而其他细菌很少液化明胶。 2.吲哚（靛基质）试验：肠杆菌科细菌的鉴定。 3.硫化氢试验：沙门菌属、爱德华菌属、亚利桑那菌属、枸橼酸杆菌属、变形杆菌属细菌，绝大多数硫化氢阳性，其他菌属阴性。 4.尿素分解试验：肠杆菌科中变形杆菌属细菌的鉴定。奇异变形杆菌和普通变形杆菌脲酶阳性，另外雷氏普罗威登菌和摩根菌为阳性，而斯氏和产碱普罗威登菌阴性。 5.苯丙氨酸脱氨酶试验：用于肠杆菌科细菌的鉴定。变形杆菌属、普罗威登斯菌属和摩根菌属细菌均为阳性，肠杆菌科中其他细菌均为阴性。 6.氨基酸脱羧酶试验：用于肠杆菌科细菌的鉴定。如沙门菌属中除伤寒和鸡沙门菌外，其余沙门菌的赖氨酸和鸟氨酸脱羧酶均为阳性。志贺菌属除宋内和鲍氏志贺菌外，其他志贺菌均为阴性。
碳源和氮源利用试验
1.枸橼酸盐利用试验：在肠杆菌科中埃希菌属、志贺菌属、爱德华菌属和耶尔森菌属均为阴性，沙门菌属、克雷伯菌属通常为阳性。 2.丙二酸盐利用试验：克雷伯菌属为阳性，枸橼酸杆菌属、肠杆菌属和哈夫尼亚菌属中有些菌种也呈阳性，其他菌属均为阴性。
各种酶类试验
1.氧化酶试验：用于肠杆菌科细菌与假单胞菌的鉴别，前者为阴性，后者为阳性。奈瑟菌属、莫拉菌属细菌也呈阳性反应。 2.过氧化氢酶试验（触酶试验）：革兰阳性球菌中，葡萄球菌和微球菌均产生过氧化氢酶，而链球菌属为阴性，故此试验常用于革兰阳性球菌的初步分群。 3.硝酸盐还原试验：肠杆菌科细菌均能还原硝酸盐为亚硝酸盐；铜绿假单胞菌、嗜麦芽窄食单胞菌等假单胞菌可产生氮气；有些厌氧菌如韦荣球菌等试验也为阳性。 4.脂酶试验：用于厌氧菌的鉴别。类杆菌属中的中间类杆菌产生脂酶，其他类杆菌则为阴性；芽胞梭菌属中产芽胞梭菌、肉毒梭菌和诺维梭菌也有此酶，而其他梭菌为阴性。 5.卵磷脂酶试验：主要用于厌氧菌的鉴定。产气荚膜梭菌、诺维梭菌产生此酶，其他梭菌为阴性。 6.DNA酶试验：在革兰阳性球菌中只有金黄色葡萄球菌产生DNA酶，在肠杆菌科中沙雷菌和变形杆菌产生此酶，故本试验可用于细菌的鉴别。 7.凝固酶试验：作为鉴定葡萄球菌致病性的重要指标。 8.CAMP试验：在链球菌中，只有B群链球菌CAMP试验阳性，故可作为特异性鉴定。 9.胆汁溶菌试验：用于肺炎链球菌与甲型链球菌的鉴别，前者为阳性，后者为阴性。
抑菌试验
1.0/129抑菌试验：用于弧菌科的属间鉴别，弧菌属、邻单胞菌属对0/129敏感，而气单胞菌属耐药。 2.杆菌肽试验：用于A群链球菌与非A群链球菌的鉴别。
3.奥普托欣（Optochin）试验：用于肺炎链球菌与其他链球菌的鉴别。
血液感染常见病原菌
| 革兰阳性 | 革兰阴性 | |
|---|---|---|
| 球菌 | 金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌、A、B群链球菌、肺炎链球菌、肠球菌、草绿色链球菌 | 脑膜炎奈瑟菌、卡他布兰汉菌 |
| 杆菌 | 产单核细胞李斯特菌、炭疽杆菌、结核分枝杆菌、产气荚膜梭菌 | 大肠埃希菌、伤寒、副伤寒沙门菌、克雷伯菌、沙雷菌、铜绿假单胞菌、不动杆菌、气单胞菌、流感嗜血杆菌、布鲁菌属、嗜肺军团菌、类杆菌 |
| 真菌 | 假丝酵母菌、曲酶菌、隐球菌、球孢子菌 | |
| 中枢神经系统感染常见病原菌 |
| 革兰阳性菌 | 革兰阴性菌 | 病毒 | 真菌及其他 |
|---|---|---|---|
| 葡萄球菌 | 脑膜炎奈瑟菌 | 乙型脑炎病毒 | 新生隐球菌 |
| 肺炎链球菌 | 卡他莫拉菌 | 柯萨奇病毒 | 假丝酵母菌 |
| 草绿色链球 菌 | 流感嗜血杆菌 | 脊髓灰质炎病毒 | 钩端螺旋体 |
| A群链球菌 | 肠杆菌科细菌 | 新肠道病毒68-71型 | |
| B群链球菌 | 非发酵菌 | 狂犬病毒 | |
| 结核分枝杆菌 | 炎杆菌 | ||
| 产单核李斯特菌 | |||
| 消化链球菌 |
呼吸道感染常见病原菌
| 革兰阳性 | 革兰阴性 | |
|---|---|---|
| 球菌 | 葡萄球菌；肺炎链球菌；化脓性链球菌；肠球菌 | 卡他莫拉菌；脑膜炎奈瑟菌 |
| 杆菌 | 白喉棒状杆菌；结核分枝杆菌；炭疽芽胞杆菌 | 流感嗜血杆菌；大肠埃希菌；克雷伯菌；铜绿假单胞菌；肺炎支原体；军团菌；百日咳杆菌 |
| 真菌 | 白假丝酵母菌；隐球菌；曲霉菌；毛霉菌 | |
| 病毒 | 流感病毒；副流感病毒；呼吸道合胞病毒；腺病毒；麻疹病毒；巨细胞病毒 |
尿路感染常见病原菌
| 革兰阳性 | 革兰阴性 | |
|---|---|---|
| 球菌 | 葡萄球菌属；肠球菌；化脓性链球菌 | 淋病奈瑟菌 |
| 杆菌 | 结核分枝杆菌 | 大肠埃希菌；肠杆菌；非发酵菌；变形杆菌；沙门菌；沙雷菌；阴道加德纳菌；布鲁菌属；克雷伯菌 |
| 其他 | 真菌、厌氧菌 | |
| 消化道感染常见病原菌 |
| 肠毒素为主的病原菌 | 侵袭性为主的病原菌 | 病毒 |
|---|---|---|
| 金黄色葡萄球菌；霍乱弧菌；志贺菌属；大肠埃希菌（ETEC、EHEC、EAggEC）；产气荚膜梭菌；艰难梭菌 | 沙门菌属；志贺菌属；，大肠埃希菌（EPEC、EIEC）；小肠结肠炎耶尔森菌；副溶血弧菌；结核分枝杆菌；白假丝酵母菌 | 轮状病毒，埃可病毒；Norwalk 病毒；腺病毒 |
创伤和外科感染常见病原菌
| 革兰阳性 | 革兰阴性 | |
|---|---|---|
| 球菌 | 金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌、肺炎链球菌、肠球菌、消化链球菌 | 脑膜炎奈瑟菌、卡他布兰汉菌 |
| 杆菌 | 炭疽杆菌、结核分枝杆菌、产气荚膜杆菌、非结核分枝杆菌、破伤风梭菌 | 大肠埃希菌、克雷伯菌、变形杆菌、铜绿假单胞菌、流感嗜血杆菌、类杆菌、梭杆菌 |
| 其他 | 放线菌（衣氏放线菌、诺卡菌） |